Imunodeficience jsou stavy, při kterých není organizmus schopen účinné obrany vůči infekci. Toto onemocnění se projevuje zvýšeným sklonem k infekcím, které mají delší a těžší průběh, recidivují, popř. probíhají chronicky. Mezi nejznámější buněčnou imunodeficienci patří DiGeorgův syndrom. Jde o poruchu vývoje již v intrauterinním životě a novorozenci mají různé vývojové vady – poruchu aortálního oblouku, což vede ke srdečním vadám. Typické znaky, podle kterých je možné onemocnění diagnostikovat jen podle vzhledu dítěte, jsou široká nosní přepážka a nápadně nízko umístěné ušní boltce.
Z hlediska imunitního systému se jedná o T-buněčný deficit, tj. pacienti mají v periferní krvi snížený počet CD3 pozitivních buněk.
Fenotypizace lymfocytů u imunodeficience průtoková cytometrie